خوب اولا eclipse فقط یک IDE هست و کلی پلاگین که حتی پلاگین C++ , چیزهای دیگه رو داره.
شما برای نصب eclipse فقط به JDK نیاز دارید که شامل JVM یعنی ماشین مجازی جاوا و لایبرری های دیگه می شه. حتی JVM هم کافی هست که خوب حتما همه دارید.
بعد eclipse رو نصب کنید(البته eclipse ورژن portable هم داره که فقط اجراش می کنید) اول سوالی راجب workSpace می پرسه که فولدری هست پروژه های شما رو توش تگه داری می کنه و بعد اجرا می شه.
حالا شما فقط می تونی پروژه ی جاوا بنویسی. برای نوشتن برنامه ی موبایل یه سری به eclipseMe.org بزنید که پلاگین برای نوشتن برنامه های موبایل هست.
خوب این پلاگین هم برای شروع به کار نیاز داره WTK شما رو بشناسه که همون emulator هست که نصب کردید.
روش کار خیلی سادس و تمامش رو تو سایت eclipseMe توضیح داده.